生產每一種芽苗菜，育苗盤的消毒工作是少不了的，苗盤的消毒分兩步，第一步：用高錳酸鉀溶液浸泡苗盤，第二步：浸泡好的苗盤在太陽下暴曬3個小時，每一次生產完，就可以對盤子進行消毒了，將消毒好的苗盤放在干燥的地方備用，防止種子浸泡好，而盤子卻沒有消毒好，錯過最佳播種時期。
生產場地也要定期消毒，可以用84消毒液配水或者高錳酸鉀溶液，用噴壺對場地噴灑，注意下層噴水時，不要把消毒液噴到苗上。
當棚內濕度較低時，一定采取保濕措施，濕度過高時，及時通風透氣，防止爛苗，倒苗。棚內溫度高時，高于40°就要遮陽網降溫，否則，容易促長，芽體變細而長。
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